Расположенное на высоте около 110 м над уровнем моря, озеро Кутарамакан разделено узким проливом, создающим сильное течение в южном направлении. Если смотреть с высоты, кажется, что это два отдельных водоема, на поверхностях которых «рассыпаны» разнокалиберные острова. Крупнейший даже имеет собственное имя — «Пирамидальный».
По площади озерного зеркала Кутарамакан занимает 21 место в рейтинге озер Красноярского края. Почти 90 кв. км (!). При этом самая узкая часть поверхности составляет всего 300 м, а самая широкая — 2,5 км. Глубина водоема достигает 150 м. Дно характеризуется сложным рельефом, где чередуются впадины, мелководные участки, скалистые гряды, песчаные банки. Крупными реками и небольшими протоками Кутарамакан связано с несколькими озерами плато, в том числе с самыми глубокими — Ламой и Хантайским.